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微量接触类生物检材的游离 DNA 问题分析

董会 魏丽 张涛 王晶 李彩霞 刘超

董会, 魏丽, 张涛, 王晶, 李彩霞, 刘超. 微量接触类生物检材的游离 DNA 问题分析[J]. 分子影像学杂志, 2015, 38(3): 177-181. doi: 10.3969/j.issn.1674-4500.2015.03.01
引用本文: 董会, 魏丽, 张涛, 王晶, 李彩霞, 刘超. 微量接触类生物检材的游离 DNA 问题分析[J]. 分子影像学杂志, 2015, 38(3): 177-181. doi: 10.3969/j.issn.1674-4500.2015.03.01
Hui DONG, Li1 WEL, Tao ZHANG, Jing WANG, Caixia LI, Chao LIU. Explorations of cell-free DNA on trace touch DNA samples[J]. Journal of Molecular Imaging, 2015, 38(3): 177-181. doi: 10.3969/j.issn.1674-4500.2015.03.01
Citation: Hui DONG, Li1 WEL, Tao ZHANG, Jing WANG, Caixia LI, Chao LIU. Explorations of cell-free DNA on trace touch DNA samples[J]. Journal of Molecular Imaging, 2015, 38(3): 177-181. doi: 10.3969/j.issn.1674-4500.2015.03.01

微量接触类生物检材的游离 DNA 问题分析

doi: 10.3969/j.issn.1674-4500.2015.03.01
详细信息
    作者简介:

    董会,硕士,E-mail: xinyidonghui@126.com

    通讯作者:

    李彩霞,博士,E-mail: licaixia@tsinghua.org.cn

    刘超,博士生导师,E-mail: liuchaogaj@21cn.com

Explorations of cell-free DNA on trace touch DNA samples

  • 摘要: 目的探究接触类生物检材的游离DNA问题,游离DNA和细胞内DNA含量的比例问题,以及游离DNA在法医检验中的影响。方法对手部、面部和足部的皮肤及口腔粘膜进行模拟微量接触类检材的制备,对模拟检材进行浸泡,对游离DNA进行定量和STR扩增,对剩余检材使用常规程序进行DNA提取、定量和STR扩增,并对结果进行分析和讨论。 结果实验观察到,78.55%的样品检测到了游离DNA,其中,手部模拟检材的游离DNA检测率为82.1%,脸部模拟检材的游离DNA检测率为82.1%,口腔模拟检材的游离DNA检测率为96.4%,足部模拟检材的游离DNA检测率为53.6%,微量接触类检材中游离DNA量占DNA总量的12.9%。 结论接触类生物检材中提取到的DNA,除了包括细胞内DNA,还存在一定比例的细胞外游离DNA,这为微量接触类检材的DNA有效提取和检验提供了新的理论依据。

     

  • 图  1  手部、面部、足部和口腔拭子分别在游离DNA的量和细胞内DNA的量的统计学比较(P值)

    黄色部分是游离DNA量的比较P值, 绿色部分是细胞内DNA量的比较P值.

    图  2  手部、面部、足部和口腔拭子的游离DNA的量与细胞内DNA的量的比例

    图  3  总体微量接触类检材的游离DNA的量与细胞内DNA的量的比例

    图  4  游离DNA和细胞内DNA获得的等位基因数

    图  5  手部、面部、足部和口腔拭子的游离DNA和细胞内DNA获得的等位基因数的比例

    图  6  7名个体的游离DNA量和细胞内DNA量之间的比较(P值)

    黄色部分是游离DNA量的比较P值, 绿色部分是细胞内DNA量的比较P值.

    图  7  7名个体的微量接触类检材的游离DNA的量与细胞内DNA的量的比例

    表  1  表1 手部、面部、脚部和口腔拭子的游离DNA量和细胞内DNA量(ng)

    Table  1.   英文标题

    个体游离DNA细胞内DNA
    手部面部足部口腔拭子手部面部足部口腔拭子
    10.170.260.160.083.414.220.221910.34
    200.020.0312.771.160.30.38350.46
    30.40.320.088.782.581.760.89970.76
    40.170.160.3832.160.71.131.04763.2
    50.220.410.1114.160.432.620.611097.93
    60.040.140.027.410.572.150.431152.68
    70.440.380.0621.230.760.251.481018.82
    下载: 导出CSV

    表  2  手部、面部、脚部和口腔拭子的游离DNA和总DNA的STR等位基因数

    个体游离DNA细胞内DNA
    手部面部足部口腔拭子手部面部足部口腔拭子
    142351712430
    20471275529
    3136112211111927
    4857317111331
    579132911171029
    606219822229
    7511229129329
    下载: 导出CSV
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-03-21
  • 刊出日期:  2015-08-01

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